Секретар Министарства руководи Секретаријатом Министарства. У оквиру Секретаријата Министарства обављају се послови:
- правни;
- кадровски:
- организациони,;
- финансијско-плански и рачуноводствени послови;
- аналитичко-информациони;
- послови везани за административно-техничке, помоћне и заједничке активности, као и остале послове из ових области који су утврђени Програмом рада Министарства и Владе Републике Српске.